Zoe打算到Cafe Diem打零工，这让一向溺爱女儿的Carter警长十分担心－－不过，真正的大麻烦正在等着他。Henry Deacon为了救Kevin而严重危害了G.D.的安全（参见上一季），不得不面临一段很长时间的牢狱生活；Nathan Stark向Allison Blake提出复婚；Zane Donovan、Fargo和Larry正在筹划新型反导系统 "蝰蛇"（Viper）的测试工作。与此同时，国防部派来一名叫Eva Throne的女人对G.D.进行全方位评估。这个女人素有 "公司毁灭者" 之称，是个冷血无情的厉害角色。
按照最初的设计，"蝰蛇" 系统的测试工作非常简单，应该很快就能完成。由Ethan Edison博士研制并建造的几架无人靶机将发动模拟攻击，而 "蝰蛇" 系统会 "毫不费力" 地将它们 "一网打尽"－－这项试验已经进行过很多次，从来都没有出过问题。Throne的到来令众人全都感到紧张不安，唯有爱拍马屁的Larry把这当作自己升迁的好机会，极尽谄媚之能事。
试验开始了，所有的靶机都被 "蝰蛇" 系统击落－－除了代号叫 "Martha" 的那一架。它不仅安然无恙，而且用凶猛的反击火力摧毁了 "蝰蛇" 系统，消失在落日余晖中。所有的远程遥控系统都已失效，科学家们无计可施。现在，抓住Martha成了Carter的头号任务。
Carter通过咨询Edison博士，了解了他的苦衷－－尽管他的创造十分成功，但终究要毁于一旦，这让他心中很不好受。Martha装配了一台会自我学习的智能计算机，但她学习的速度未免太快了！她本该是个 "刚学走路的婴儿"，但她的行为就像到了 "青春期" 一样叛逆。Carter担心Martha在感受到威胁的时候会伤害别人－－事实上，Martha一路追踪Carter，并闯进了警察局办公室。让Carter没有想到的是，Martha竟然会隐形！Carter和Jo费了九牛二虎之力才把Martha关进 "大牢"，Martha竟然钻破后墙，扬长而去。
Carter和Allison来到Edison的实验室，遇见Edison的妻子Mina拿着香槟酒准备庆贺Edison的 "胜利"。Edison说，他并没有赋予Martha隐形的功能，她是因为吸收了太多的能量才如此的。隐形消耗的能量极大，Martha必须返回实验室充电。正在此时，Throne带人来到Edison的实验室，没收了剩余的无人靶机。隐形的Martha一直潜伏在暗处，将一切看了个明明白白。
Cafe Diem，在Vincent的 "超级核聚变大冰箱" 里，Zoe见到了前来 "充电" 的Martha。Zoe不知道Martha是个 "危险分子"，两人处得还不错。尽管Carter的Jo随后制服了Martha，但聪明的Martha将计就计混入G.D.，带着所有被没收的无人靶机 "集体起义"。Throne眼看局面不可收拾，于是要求国防部派出F-16战斗机前来支援。Carter、Stark和Allison并不同意用暴力手段解决此事，但是双方都已进入射程范围，一场空战即将在Eureka上空打响！
