其实结局不知道也罢
大结局第20集《真相》The Truth里，穆德又回来了，但是他却被关进了监狱，他被控以谋杀，并要接受审判。但是穆德否认指控，他接受审判时，探员约翰-道吉特也站出来证明穆德没罪，而史考莉也出示尸体检验报告来证明穆德的清白，但是这一切并没能为穆德摆脱罪名，穆德被再次被关进了监狱。约翰-道吉特和史基纳等人来到了监狱营救穆德，与此同时超级战士也来了，但是穆德他们早一步逃出了监狱。史考莉和儿子来接应穆德一行人，接着穆德和史考莉两人一起开车去找寻真相，证明外星人的阴谋。穆德和史考莉在途中遇到了一位印第安老人，老人向他们证实了外星人的存在，但是超级战士也追寻他们而来，老人死了。
最终史考莉得知了2012年12月22日外星人要入侵地球的计划，而穆德很早就知道了这个计划，也就是被抓走的原因。
结尾：新墨西哥的一个旅店里穆德和史考莉紧紧抱在一起，他们就这样抱着，一切看上去是那么的和谐，镜头颜色变暗，OK！结束！
其实这个结尾实在是无奈之举，第七季大卫杜楚尼不在出演以后，X档案的收视率就一路下滑，为了保证X档案能顺顺当当有个了解，导演迫不得已吧杜楚尼请回来拍了最后两集，像X档案这种以阴谋论为核心的片子实际上不能指望他能有什么结论的。这不今年即将上映的X档案大电影2就彻底放弃了阴谋论了。
